MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSX

Total Repeats: 1895

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005232	AG	3	6	481	486	50 %	0 %	50 %	0 %	38505826
2	NC_005232	GAA	2	6	558	563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505826
3	NC_005232	TAT	2	6	620	625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505826
4	NC_005232	GGA	2	6	914	919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505826
5	NC_005232	GAT	2	6	942	947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505826
6	NC_005232	GAA	2	6	984	989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505826
7	NC_005232	C	6	6	994	999	0 %	0 %	0 %	100 %	38505826
8	NC_005232	AGG	2	6	1196	1201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505826
9	NC_005232	TCC	2	6	1220	1225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505826
10	NC_005232	C	6	6	1269	1274	0 %	0 %	0 %	100 %	38505826
11	NC_005232	C	8	8	1282	1289	0 %	0 %	0 %	100 %	38505826
12	NC_005232	CAGTT	2	10	1303	1312	20 %	40 %	20 %	20 %	38505826
13	NC_005232	TCA	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505826
14	NC_005232	CAG	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505826
15	NC_005232	GACG	2	8	1410	1417	25 %	0 %	50 %	25 %	38505826
16	NC_005232	AAGGT	2	10	1462	1471	40 %	20 %	40 %	0 %	38505826
17	NC_005232	TTG	2	6	1474	1479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505826
18	NC_005232	GCC	2	6	1548	1553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505826
19	NC_005232	ATG	2	6	1555	1560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505826
20	NC_005232	TGG	2	6	1596	1601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505826
21	NC_005232	GAA	2	6	1734	1739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505826
22	NC_005232	A	6	6	1909	1914	100 %	0 %	0 %	0 %	38505826
23	NC_005232	CGG	2	6	1937	1942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505826
24	NC_005232	CAA	2	6	1958	1963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505826
25	NC_005232	TTA	2	6	1965	1970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505826
26	NC_005232	GTG	2	6	2065	2070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505826
27	NC_005232	GC	3	6	2100	2105	0 %	0 %	50 %	50 %	38505826
28	NC_005232	GAA	2	6	2129	2134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505826
29	NC_005232	TGG	2	6	2306	2311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505826
30	NC_005232	CTG	2	6	2335	2340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505826
31	NC_005232	CGC	2	6	2357	2362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505826
32	NC_005232	TGGCAT	2	12	2417	2428	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	38505826
33	NC_005232	T	6	6	2463	2468	0 %	100 %	0 %	0 %	38505826
34	NC_005232	ATT	2	6	2823	2828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505826
35	NC_005232	CGG	2	6	2834	2839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505826
36	NC_005232	CAT	2	6	2927	2932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505826
37	NC_005232	GCG	2	6	3008	3013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505826
38	NC_005232	GAA	2	6	3598	3603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505827
39	NC_005232	CAA	2	6	3618	3623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505827
40	NC_005232	CGG	2	6	3706	3711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505827
41	NC_005232	A	7	7	3847	3853	100 %	0 %	0 %	0 %	38505828
42	NC_005232	ACA	2	6	3888	3893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505828
43	NC_005232	TGA	2	6	3972	3977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505828
44	NC_005232	GCTGA	2	10	4167	4176	20 %	20 %	40 %	20 %	38505829
45	NC_005232	GCC	2	6	4182	4187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505829
46	NC_005232	GCG	2	6	4197	4202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505829
47	NC_005232	CTG	2	6	4231	4236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505829
48	NC_005232	CGG	2	6	4264	4269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505829
49	NC_005232	CGAAGG	2	12	4354	4365	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	38505829
50	NC_005232	GGC	2	6	4397	4402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505829
51	NC_005232	GATG	2	8	4462	4469	25 %	25 %	50 %	0 %	38505830
52	NC_005232	TCGG	2	8	4495	4502	0 %	25 %	50 %	25 %	38505830
53	NC_005232	CTG	2	6	4619	4624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505830
54	NC_005232	CGC	2	6	4633	4638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505830
55	NC_005232	CGA	2	6	4747	4752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505830
56	NC_005232	A	6	6	4790	4795	100 %	0 %	0 %	0 %	38505830
57	NC_005232	GGC	2	6	4825	4830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505830
58	NC_005232	C	7	7	4838	4844	0 %	0 %	0 %	100 %	38505830
59	NC_005232	T	6	6	5029	5034	0 %	100 %	0 %	0 %	38505830
60	NC_005232	TGG	2	6	5097	5102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505830
61	NC_005232	CAAT	2	8	5146	5153	50 %	25 %	0 %	25 %	38505830
62	NC_005232	TGGC	2	8	5166	5173	0 %	25 %	50 %	25 %	38505830
63	NC_005232	TGG	2	6	5176	5181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505830
64	NC_005232	TACC	2	8	5216	5223	25 %	25 %	0 %	50 %	38505830
65	NC_005232	GGA	2	6	5235	5240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505830
66	NC_005232	GGC	2	6	5280	5285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505831
67	NC_005232	GGC	2	6	5298	5303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505831
68	NC_005232	ACC	2	6	5308	5313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505831
69	NC_005232	GACATC	2	12	5359	5370	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	38505831
70	NC_005232	CCG	2	6	5381	5386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505831
71	NC_005232	TGCCA	2	10	5502	5511	20 %	20 %	20 %	40 %	38505831
72	NC_005232	GGTT	2	8	5560	5567	0 %	50 %	50 %	0 %	38505831
73	NC_005232	GTAATC	2	12	5636	5647	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	38505831
74	NC_005232	GCC	2	6	5668	5673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505831
75	NC_005232	TGG	2	6	5696	5701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505831
76	NC_005232	CGG	2	6	5736	5741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505831
77	NC_005232	GTG	2	6	5785	5790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505831
78	NC_005232	G	6	6	5808	5813	0 %	0 %	100 %	0 %	38505831
79	NC_005232	CCA	2	6	5894	5899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505831
80	NC_005232	GGT	2	6	5934	5939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505831
81	NC_005232	CAT	2	6	5967	5972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505831
82	NC_005232	CCG	2	6	6005	6010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505831
83	NC_005232	CGA	2	6	6036	6041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505831
84	NC_005232	TGA	2	6	6108	6113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505831
85	NC_005232	GCCTTT	2	12	6142	6153	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	38505831
86	NC_005232	GGA	2	6	6172	6177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505831
87	NC_005232	TCCAA	2	10	6406	6415	40 %	20 %	0 %	40 %	38505832
88	NC_005232	AGT	2	6	6471	6476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505832
89	NC_005232	GGGA	2	8	6482	6489	25 %	0 %	75 %	0 %	38505832
90	NC_005232	CAT	2	6	6549	6554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505832
91	NC_005232	AAACCC	2	12	6575	6586	50 %	0 %	0 %	50 %	38505832
92	NC_005232	TGG	2	6	6617	6622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505832
93	NC_005232	CAT	2	6	6630	6635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505832
94	NC_005232	GGC	2	6	6742	6747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505832
95	NC_005232	ACT	2	6	6822	6827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505832
96	NC_005232	C	6	6	6875	6880	0 %	0 %	0 %	100 %	38505832
97	NC_005232	GTTG	2	8	6884	6891	0 %	50 %	50 %	0 %	38505832
98	NC_005232	GGA	2	6	6930	6935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505832
99	NC_005232	CCA	2	6	6983	6988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505832
100	NC_005232	CAA	2	6	7008	7013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505832
101	NC_005232	C	6	6	7021	7026	0 %	0 %	0 %	100 %	38505832
102	NC_005232	C	7	7	7063	7069	0 %	0 %	0 %	100 %	38505832
103	NC_005232	TGA	2	6	7109	7114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505832
104	NC_005232	CAC	2	6	7117	7122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505832
105	NC_005232	TGA	2	6	7164	7169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505832
106	NC_005232	GCG	2	6	7210	7215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505832
107	NC_005232	TGGGC	2	10	7230	7239	0 %	20 %	60 %	20 %	38505832
108	NC_005232	TTC	2	6	7323	7328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505832
109	NC_005232	GAG	2	6	7366	7371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505832
110	NC_005232	GGC	2	6	7616	7621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505833
111	NC_005232	ACT	2	6	7640	7645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505833
112	NC_005232	AAT	2	6	7658	7663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505833
113	NC_005232	ACT	2	6	7673	7678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505833
114	NC_005232	AAG	2	6	7776	7781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505833
115	NC_005232	CCT	2	6	7819	7824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505833
116	NC_005232	C	6	6	7892	7897	0 %	0 %	0 %	100 %	38505833
117	NC_005232	GAA	2	6	7913	7918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505833
118	NC_005232	GCCAAG	2	12	8003	8014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505833
119	NC_005232	GCC	2	6	8107	8112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505833
120	NC_005232	CCG	2	6	8224	8229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505833
121	NC_005232	G	6	6	8271	8276	0 %	0 %	100 %	0 %	38505833
122	NC_005232	GGC	2	6	8305	8310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505833
123	NC_005232	ACC	2	6	8340	8345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505833
124	NC_005232	CCG	2	6	8359	8364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505833
125	NC_005232	GGA	2	6	8368	8373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505833
126	NC_005232	GGA	2	6	8461	8466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505833
127	NC_005232	TCAAA	2	10	8485	8494	60 %	20 %	0 %	20 %	38505833
128	NC_005232	CGC	2	6	8516	8521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505833
129	NC_005232	ACT	2	6	8576	8581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505833
130	NC_005232	TGG	2	6	8710	8715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505834
131	NC_005232	ACA	2	6	8716	8721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505834
132	NC_005232	CAA	2	6	8742	8747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505834
133	NC_005232	CAC	2	6	8774	8779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505834
134	NC_005232	A	6	6	8848	8853	100 %	0 %	0 %	0 %	38505834
135	NC_005232	CCATTG	2	12	8905	8916	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	38505834
136	NC_005232	CCG	2	6	8985	8990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505834
137	NC_005232	AAT	2	6	8994	8999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505834
138	NC_005232	CGC	2	6	9080	9085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505834
139	NC_005232	CAA	2	6	9099	9104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505834
140	NC_005232	TCAAA	2	10	9128	9137	60 %	20 %	0 %	20 %	38505834
141	NC_005232	AGCTG	2	10	9161	9170	20 %	20 %	40 %	20 %	38505834
142	NC_005232	GTA	2	6	9192	9197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505834
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144	NC_005232	GAG	2	6	9392	9397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505834
145	NC_005232	GGT	2	6	9429	9434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505834
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149	NC_005232	ACT	2	6	9655	9660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505835
150	NC_005232	GAT	2	6	9662	9667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505835
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152	NC_005232	CTTT	2	8	9700	9707	0 %	75 %	0 %	25 %	38505835
153	NC_005232	GATT	2	8	9770	9777	25 %	50 %	25 %	0 %	38505835
154	NC_005232	AAAGG	2	10	9875	9884	60 %	0 %	40 %	0 %	38505835
155	NC_005232	CATT	2	8	9974	9981	25 %	50 %	0 %	25 %	38505835
156	NC_005232	T	6	6	9991	9996	0 %	100 %	0 %	0 %	38505835
157	NC_005232	ATA	2	6	10015	10020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505835
158	NC_005232	TCA	2	6	10031	10036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505835
159	NC_005232	ATG	2	6	10477	10482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505836
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161	NC_005232	GTG	2	6	10668	10673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505836
162	NC_005232	TGAC	2	8	10687	10694	25 %	25 %	25 %	25 %	38505836
163	NC_005232	ACT	2	6	10750	10755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505836
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171	NC_005232	A	7	7	11573	11579	100 %	0 %	0 %	0 %	38505837
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263	NC_005232	AT	3	6	16123	16128	50 %	50 %	0 %	0 %	38505839
264	NC_005232	TCAA	2	8	16207	16214	50 %	25 %	0 %	25 %	38505839
265	NC_005232	AATGT	2	10	16252	16261	40 %	40 %	20 %	0 %	38505839
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401	NC_005232	AGT	2	6	22897	22902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505846
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403	NC_005232	A	6	6	22950	22955	100 %	0 %	0 %	0 %	38505846
404	NC_005232	T	6	6	23068	23073	0 %	100 %	0 %	0 %	38505847
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